căsătorii
Borgia a fost căsătorită pentru prima dată înainte de a intra în anii adolescenței. Ea a fost logodită cu unul nobil și apoi încă înainte ca tatăl ei să angajamentele dizolvat, astfel încât el ar putea aranja pentru ei să se fi căsătorit cu Giovanni Sforza, 15 ani mai în vârstă, care a fost Domnul de Pesaro și numărul de Catignola. Tatăl lui Borgia, Cardinalul Rodrigo Borgia, a fost numit Papa Alexandru al VI-lea în 1492, iar Borgia s-a căsătorit un an mai târziu.,patru ani mai târziu, căsătoria lui Borgia a devenit mai puțin avantajoasă din punct de vedere politic, iar Papa Alexandru al VI-lea a căutat să o anuleze sub pretextul că relația nu a fost niciodată consumată. În timp ce negocierile de anulare erau în desfășurare între Borgia și Sforza, Borgia sa odihnit într-o mănăstire din apropiere. Ea a consumat în mod clar o relație cu un individ, cu toate acestea, pentru că atunci când anularea a fost acordată în mod oficial la 27 decembrie 1497, Borgia era însărcinată în șase luni.,rapoartele despre sarcina ei au fost inițial respinse, dar în martie 1498 s-a născut în secret un fiu, Giovanni (el nu va fi dezvăluit public decât trei ani mai târziu). Paternitatea copilului nu a fost niciodată stabilită, iar bârfele Romei s-au întrebat mai târziu dacă el a fost produsul incestului sau dacă Borgia era cu adevărat mama lui. Două decrete papale au fost emise în această privință, primul afirmând că Giovanni era fiul nelegitim al lui Cesare și următorul afirmând că el era fiul nelegitim al papei Alexandru.,în iulie 1498, Borgia s-a căsătorit cu Alfonso de Aragon, Ducele de Bisceglie în vârstă de 17 ani și fiul regretatului rege al Neapolelui, și au avut un copil împreună. Din păcate pentru Alfonso, până în 1500, Papa Alexandru și fratele lui Borgia, Cesare, au căutat o nouă alianță cu Franța, iar căsătoria lui Borgia cu Alfonso a fost un obstacol major.la 15 iulie 1500, Alfonso a fost înjunghiat de mai multe ori, dar a supraviețuit. Pe 18 August, norocul i s-a terminat, când, așa cum se crede în general, oamenii lui Cesare au angajat să-l stranguleze pe Alfonso până la moarte, în timp ce acesta zăcea în convalescență după rănile anterioare de înjunghiere.,după moartea lui Alfonso, tatăl lui Borgia a aranjat ca ea să se căsătorească cu Alfonso d ‘ Este, Duce de Ferrara, la începutul anului 1502. Noul soț al lui Borgia a ezitat inițial din cauza reputației Borgia. Cuplul s-a mutat curând din Roma la Ferrara, scăpând de intrigile nesfârșite ale tatălui și fratelui ei, iar perechea a avut mai mulți copii (dintre care mulți au murit tineri). Cu această căsătorie, Borgia a reușit să se ridice deasupra reputației familiei sale și a prosperat în noile sale împrejurimi.