guvernul Mexican și vorbitoare de limba spaniolă Californienii au devenit din ce în ce mai suspicios din motive de „Americani” din Statele Unite., În 1844, John Charles Freemont a condus un partid de Armata topografice ingineri care „accidental” a trecut Sierra în California și a călătorit lungimea de Valea San Joaquin înainte de a face drumul lor de acasă. În 1845, un comodor din Marina SUA, dezinformat despre relațiile dintre țara sa și Mexic, a navigat în portul Monterey și a declarat o victorie într-un război inexistent. Frémont s-a întors în decembrie 1845, aparent pentru a supraveghea trecerile prin Sierras folosite de trenurile emigranților americani.,
Astfel Freemont și șaizeci armate cercetași și soldați au fost la îndemână în primăvara anului 1846, când circulat zvonuri de război iminent între Mexic și Statele Unite ale americii., Pe 10 iunie, americanii de lângă Sonoma au luat armele și au declarat o republică independentă din California, cu un steag de casă care poartă o singură stea și imaginea pictată a unui grizzly, câștigând astfel revolta lor numele revoltei steagului ursului. Frémont s-a alăturat rebelilor în Republica lor de scurtă durată, care s-a încheiat pe 9 iulie, Când americanii au aflat că națiunea lor și Mexicul erau oficial în război și că o navă de luptă Americană se afla în portul Monterey. Frémont și oamenii săi s-au înscris în operațiunile militare oficiale, iar Republica California a încetat să mai existe.,
au fost multe bătălii grele cu trupele mexicane și fermierii californieni pe de o parte și soldații și coloniștii americani pe de altă parte înainte ca Războiul Mexican din California să se încheie în favoarea americanilor cu capitularea Cahuenga în ianuarie 1847. Înainte de sfârșitul acelei luni, a sosit un batalion de mormoni care se înrolaseră în armată în Iowa. În martie, li s-au alăturat 1.000 de membri ai unui regiment din New York, care au ajuns și ei să lupte într-un război care s-a terminat., Cu toate acestea, întrucât Mormonii erau obligați să se alăture lui Brigham Young și coloniei sale, situată acum în Utah, și întrucât majoritatea newyorkezilor s-au înrolat cu promisiunea că vor putea rămâne în California după război, nu au fost dezamăgiți să rateze luptele.ei s-au mulțumit să-și aștepte timpul să se familiarizeze cu cea mai nouă parte a Statelor Unite. Teritoriul Alta California a fost apoi acasă la 150.000 de popoare indigene și 14.000 de locuitori de origine europeană și mexicană., Majoritatea triburilor și clanurilor indigene supraviețuitoare trăiau în nordul muntos, unde părinții misiunii nu răspândiseră creștinismul și bolile Europene, în timp ce majoritatea acestor 14.000 de nou-veniți trăiau în sud, grupați în jurul Monterey și Los Angeles. Au existat europeni în nord, unii care trăiesc în mica comunitate comercială din Yerba Buena, recent redenumită San Francisco, iar alții s-au grupat în jurul fortului Sutter de pe Sacramento. Toți și-au dat seama că Guvernul Statelor Unite va aduce mari schimbări, dar nimeni nu ar fi putut anticipa cât de repede vor veni aceste schimbări.