después de ganar el interregno, Mehmed se coronó sultán en la ciudad Tracia de Edirne que se encontraba en la parte europea del Imperio (el área que divide los lados Anatolios y europeos del Imperio, Constantinopla y la región circundante, todavía estaba en manos del Imperio Bizantino), convirtiéndose en Mehmed I. consolidó su poder, hizo de Edirne la más importante de las capitales duales, y conquistó partes de Albania, el emirato Jandarí y el reino armenio de Cilicia de Los Mamelucos., Teniendo en cuenta sus muchos logros, Mehmed es ampliamente conocido como el «segundo fundador» del Sultanato Otomano.
poco después de que Mehmed comenzara su reinado, su hermano Mustafa Çelebi, que originalmente había sido capturado junto con su padre Bayezid I durante la Batalla de Ankara y mantenido cautivo en Samarcanda, escondido en Anatolia durante el interregno, reapareció y le pidió a Mehmed que dividiera el imperio con él. Mehmed se negó y se reunió con las fuerzas de Mustafa en la batalla, derrotándolos fácilmente., Mustafa escapó a la ciudad bizantina de Tesalónica, pero después de un acuerdo con Mehmed, el emperador bizantino Manuel II Paleólogo exilió a Mustafa a la isla de Lemnos.
Sin embargo, Mehmed todavía se enfrentaba a algunos problemas, siendo el primero el problema de su sobrino Orhan, a quien Mehmed percibía como una amenaza para su gobierno, al igual que sus difuntos hermanos lo habían sido. Supuestamente hubo un complot que lo involucró Manuel II Paleólogo, quien trató de usar a Orhan contra el sultán Mehmed; sin embargo, el sultán se enteró del complot y Orhan quedó ciego por traición, según una práctica Bizantina común.,
Además, como resultado de la Batalla de Ankara y otras guerras civiles, la población del Imperio se había vuelto inestable y traumatizada. Un movimiento social y religioso muy poderoso surgió en el Imperio y se convirtió en disruptivo. El movimiento fue dirigido por Sheikh Bedreddin (1359-1420), un famoso sufí musulmán y teólogo carismático. Era un Ulema eminente, nacido de una madre griega y un padre musulmán en Simavna (Kyprinos) al suroeste de Edirne (anteriormente Adrianópolis). Musa, el hermano de Mehmed, había hecho de Bedreddin su «qadi del ejército», o el juez supremo., Bedreddin creó un movimiento religioso populista en el Sultanato Otomano, » conclusiones subversivas que promueven la supresión de las diferencias sociales entre ricos y pobres, así como las barreras entre diferentes formas de monoteísmo.»Desarrollando con éxito una revolución social popular y sincretismo de las diversas religiones y sectas del Imperio, el movimiento de Bedreddin comenzó en el lado europeo del Imperio y experimentó una mayor expansión en Anatolia Occidental.
en 1416, el jeque Bedreddin comenzó su rebelión contra el trono., Después de una lucha de cuatro años, fue finalmente capturado por el gran visir de Mehmed Bayezid Pasha y ahorcado en la ciudad de Serres, una ciudad en la actual Grecia, en 1420.