Juan Manuel» John » Quiñones nació en San Antonio, Texas el 23 de mayo de 1952. Es un San Antoniano de quinta generación y un mexicano-americano de quinta generación. Quiñones creció en un hogar de habla hispana y no aprendió inglés hasta que comenzó la escuela a los 6 años. Cuando tenía 13 años, su padre fue despedido de su trabajo como conserje y la familia de John, incluidas las hermanas Irma y Rosemary, se unió a una caravana de trabajadores agrícolas migrantes y viajó a Traverse City, Michigan para cosechar cerezas., Más tarde ese verano, la familia Quiñones siguió la ruta migratoria para recoger tomates fuera de Toledo, Ohio. Quiñones recuerda las palabras de su padre, Bruno Quiñones, una mañana temprano en los campos de tomate de Ohio. «Juanito, ¿quieres hacer esto por el resto de tu vida? O, ¿quieres obtener una educación universitaria?». Decidido a superar los estereotipos latinoamericanos Actuales de ser inculto, decidió asistir a la Universidad., Mientras asistía a la Escuela Secundaria Brackenridge en San Antonio, Quiñones fue seleccionado para participar en el programa federal contra la pobreza, Upward Bound, que preparó a estudiantes de escuelas secundarias de barrios pobres para la Universidad. «Upward Bound me salvó la vida», dice. John asistió a la Universidad St. Mary’s, en San Antonio. Como estudiante, Quiñones también fue miembro de la fraternidad Sigma Beta-Zeta de Lambda Chi Alpha. Después de graduarse de St.Mary’s con una licenciatura en Comunicación del habla, Quiñones obtuvo su maestría en la Escuela de Periodismo de la Universidad de Columbia.