Matrimoni
Borgia è stata sposata per la prima volta prima di entrare nella sua adolescenza. Fu fidanzata con un nobile e poi con un altro, prima che il padre sciogliesse gli impegni affinché egli potesse farla sposare con Giovanni Sforza, 15 anni più anziano di lei, signore di Pesaro e conte di Catignola. Il padre di Borgia, il cardinale Rodrigo Borgia, fu nominato papa Alessandro VI nel 1492, e Borgia si sposò un anno dopo.,
Quattro anni dopo, il matrimonio di Borgia divenne meno vantaggioso politicamente, e papa Alessandro VI cercò di farlo annullare con la pretesa che la relazione non fosse mai stata consumata. Mentre le trattative di annullamento erano in corso tra i Borgia e gli Sforza, Borgia riposava in un vicino convento. Aveva chiaramente consumato un rapporto con qualche individuo, tuttavia, perché quando l’annullamento è stato ufficialmente concesso il 27 dicembre 1497, Borgia era incinta di sei mesi.,
Le notizie sulla sua gravidanza furono inizialmente confutate, ma nel marzo del 1498 nacque un figlio, Giovanni, in segreto (che sarebbe stato rivelato pubblicamente solo tre anni dopo). La paternità del bambino non fu mai stabilita, e i pettegolezzi di Roma in seguito si chiesero se fosse il prodotto dell’incesto o se Borgia fosse veramente sua madre. Due decreti papali sono stati emessi sulla questione, il primo affermando che Giovanni era il figlio illegittimo di Cesare e il successivo affermando che era il figlio illegittimo di Papa Alessandro.,
Nel luglio del 1498, Borgia sposò Alfonso d’Aragona, il diciassettenne duca di Bisceglie e figlio del defunto re di Napoli, ed ebbero un figlio insieme. Sfortunatamente per Alfonso, nel 1500, papa Alessandro e il fratello di Borgia Cesare cercarono una nuova alleanza con la Francia, e il matrimonio di Borgia con Alfonso fu un grosso ostacolo.
Il 15 luglio 1500, Alfonso fu pugnalato più volte, ma sopravvisse. Il 18 agosto, la sua fortuna si esaurì, quando, come generalmente si crede, gli uomini di Cesare assoldarono per strangolare Alfonso a morte mentre giaceva in convalescenza dalle sue precedenti ferite da arma da taglio.,
Dopo la morte di Alfonso, il padre di Borgia la fece sposare con Alfonso d’Este, duca di Ferrara, all’inizio del 1502. Il nuovo marito di Borgia era inizialmente titubante a causa della reputazione di Borgia. La coppia si trasferì presto da Roma a Ferrara, sfuggendo agli infiniti intrighi del padre e del fratello, e la coppia ebbe diversi figli (molti dei quali morirono giovani). Con questo matrimonio, Borgia riuscì a superare la reputazione della sua famiglia e prosperò nel suo nuovo ambiente.
